Прошло более девяти месяцев с момента публикации патента, который должен быть оспорен, и разбирательства по возражению не ожидаются, может быть согласно § 81 Абс. 2 Закон о патентах подать иск о недействительности в Федеральный патентный суд. За это взимается плата; могут возникнуть дополнительные расходы. Любой патент может быть предметом судебного иска, который должен быть объявлен недействительным на суверенной территории Германии.

Отсутствие патентоспособности, например, может быть заявлено в качестве причины недействительности., например, в отношении технических характеристик, которые уже были раскрыты в описании другого патента.

Могут быть основания для признания недействительным:

• отсутствие патентоспособности
• отсутствие исполняемости
• недопустимое расширение предмета патента по сравнению с вариантом заявки
• незаконное изъятие изобретения (только пострадавшая сторона может требовать)
• Расширение объема охраны патента

Решение по иску принимается в судебном порядке. В этом случае оспариваемый патент может быть сохранен. (при отклонении иска) или быть аннулированным полностью или частично (в случае частичного или полного одобрения действия). Успешный иск о недействительности приводит к аннулированию патента.. Правообладатель задним числом теряет все юридические позиции на основании заявления.

Федеральный суд является второй и последней апелляционной инстанцией.